Согласно данным Центрального архива Министерства Обороны Василий Степанович был призван в 1941-м году Алапаевским райвоенкоматом. Последнее письмо родные получили в октябре 1941-го года со штампиком 127 полевая почтовая станция, которая относилась к Брянскому фронту.
На месте, где был найден Агафонов В.С. с 25 по 27 октября в Калужской области произошло жесточайшее сражение, 93-я стрелковая дивизия понесла колоссальные потери при выполнении боевой задачи: взять рубеж обороны деревень Кузовлёво-Ольхово-Горки. Агафонов Василий Степанович героический погиб именно в этом сражении.
По просьбе родственников 23-го июня в 13:00 в деревне Мугай Махнёвского муниципального образования состоялась торжественно-траурная церемония прощания и погребения останков красноармейца Агафонова В.С. Митинг прошел у обелиска погибшим воинам. Захоронение состоялась на местном кладбище.
В торжественно-траурной церемонии прощания и погребения останков красноармейца Агафонова Василия Степановича на родине приняли участие заместитель министра образования и молодежной политики Свердловской области, Федеральная служба войск национальной гвардии Российской Федерации (Росгвардия), администрация Махневского городского округа, поисковый отряд «Сокол» (г. Екатеринбург), патриотический отряд «Юнармеец» (г. Алапаевск) Регионального отделения общероссийского общественного движения «Поисковое движение России» в Свердловской области.